Verarbeitung multimodaler medizinischer PDF-Dokumente

Kalaf, Carla (2026) Verarbeitung multimodaler medizinischer PDF-Dokumente. Masters thesis, Universität Rostock.

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Abstract

Medizinische Dokumente verbinden Fließtext, Tabellen und Abbildungen zu einer für die maschinelle Auswertung schwer zugänglichen Form und liegen häufig als PDF vor. Diese Arbeit konzipiert und erprobt einen lokal ausführbaren ETL-Prozess, der solche multimodalen medizinischen PDF-Dokumente in ein strukturiertes, abfragbares Datenmodell überführt. Der Prozess arbeitet vollständig ohne externe Dienste, sodass die verarbeiteten Dokumente die lokale Umgebung nicht verlassen und auch datenschutzsensible Inhalte verarbeitet werden können. Der Prozess gliedert sich in drei Phasen. In der Extraktionsphase überführt ein Dokumentwerkzeug den Text- und Tabelleninhalt in eine einheitliche Markdown-Repräsentation, während ein lokales Vision-Language-Modell die enthaltenen Abbildungen in textuelle Beschreibungen umsetzt. In der Transformationsphase gewinnt ein lokal ausgeführtes Sprachmodell aus dieser Repräsentation in zwei aufeinander aufbauenden Schritten zunächst typisierte Entitäten und anschließend die kausalen Beziehungen zwischen ihnen. Die Ladephase überführt diese Ergebnisse in ein relationales Datenmodell, dessen Schema gemeinsam mit der im Sprachmodell vorgegebenen Ausgabestruktur aus einer zentralen Definition hervorgeht. Die beispielhafte Anwendung auf drei medizinische Publikationen mit unterschiedlich strukturierten Bestandteilen zeigt, dass der Prozess durchgängig eine befüllte, abfragbare Repräsentation erzeugt. Die textuelle Verarbeitung trägt am weitesten und erfasst auch implizite kausale Beziehungen; die Grenzen liegen bei stark verschachtelten Tabellen, bei Diagrammen mit langen, an anderen Verbindungen ansetzenden Pfeilen, bei der auf einzelne Sätze beschränkten Kausalitätsextraktion und bei der größenbasierten Filterung von Grafikelementen. Die Arbeit ordnet diese Beobachtungen ein und leitet Ansätze für weiterführende Arbeiten ab.

Item Type:	Thesis (Masters)
Subjects:	Autorenart > Studentische Arbeiten > Masterarbeit Forschungsthemen > Digitale Bibliotheken Autorenart > Studentische Arbeiten
Depositing User:	Dbis Admin
Date Deposited:	06 Oct 2026 11:29
Last Modified:	06 Oct 2026 11:29
URI:	https://eprints.dbis.informatik.uni-rostock.de/id/eprint/1162

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